Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC8.84□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RETNLBQ9BQ08 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms