Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms