Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms