Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUSD3Q96L08 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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