Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HDAC11Q96DB2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms