Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNDC1Q96C34 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms