Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPS3Q969F9 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms