Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms