Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTTNBP2Q8WZ74 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms