Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHD5Q8TDI0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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