Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP7

PCSK9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK9Q8NBP7 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCSK9Q8NBP7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCSK9Q8NBP7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms