Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ATG4DQ86TL0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATG4DQ86TL0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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