Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APTXQ7Z2E3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms