Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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SUMO4Q6EEV6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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SUMO4Q6EEV6 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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SUMO4Q6EEV6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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SUMO4Q6EEV6 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SUMO4Q6EEV6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SUMO4Q6EEV6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SUMO4Q6EEV6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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