Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WSCD1Q658N2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms