Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SAMD13Q5VXD3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms