Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms