Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
KRTAP13-3Q3SY46 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms