Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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