Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP2B3Q16720 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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