Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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