Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SHPRHQ149N8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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