Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RFTN1Q14699 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RFTN1Q14699 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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