Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms