Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LSAMPQ13449 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms