Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CBX3Q13185 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CBX3Q13185 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CBX3Q13185 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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