Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PTPN13Q12923 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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