Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TROQ12816 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TROQ12816 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TROQ12816 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TROQ12816 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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