Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SYCNQ0VAF6 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms