Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTDSPL2Q05D32 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms