Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUCB1Q02818 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUCB1Q02818 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms