Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 UBXN8-209ENST00000620074 1058 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ZNF506-203ENST00000540806 1424 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL445070.1-201ENST00000414631 714 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL035425.1-202ENST00000436013 1142 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL606469.1-201ENST00000443224 892 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL160274.1-201ENST00000623623 1515 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 NRXN1-203ENST00000378262 1338 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms