Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NHLH2Q02577 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms