Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CENPEQ02224 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms