Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OTUD4Q01804 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms