Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MDM2Q00987 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms