Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED6P86452 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms