Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
RPS29P62273 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
RPS29P62273 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms