Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP46P62068 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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USP46P62068 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP46P62068 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP46P62068 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP46P62068 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP46P62068 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP46P62068 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP46P62068 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP46P62068 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP46P62068 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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