Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A1P43005 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms