Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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