Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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