Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNNT1P13805 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms