Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC24AO95486 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms