Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRTO14522 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRTO14522 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRTO14522 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRTO14522 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRTO14522 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRTO14522 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRTO14522 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRTO14522 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PTPRTO14522 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
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