Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVV-2B6SEH9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms