Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRD1A4D1F6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms