Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TARSL2A2RTX5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms