Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MAP3K4Q9Y6R4 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms