Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms